常设展示厅
作为一般公开展示，从本馆藏品中精选出1500余件代表冲绳自然、文化的标本及资料，陈列于1楼的常设展示厅中。此外，另设有“学校群落生境展示园”作为自然教学使用。
风树馆建筑
风树馆的核心建筑由冲绳著名建筑师金城信吉（1934-1984）设计建造，为其一生中最后的作品。他曾设计过那霸市民会馆、那霸首里城希尔顿逸林酒店等。风树馆建筑随处可见琉球式建筑特有的痕迹。其外观为红砖曲线设计，借鉴了冲绳历史城迹、传统古墓等石造建筑的优美曲线设计理念。此外，大厅入口处安置的屏风墙，也是借鉴传统民居入口处的照壁而来。
